中国媒介生物学及控制杂志 ›› 2020, Vol. 31 ›› Issue (6): 735-737.DOI: 10.11853/j.issn.1003.8280.2020.06.024
张景山1, 龙政2, 王紫鉴2, 肖文静1, 王群1, 赵宏群1
ZHANG Jing-shan1, LONG Zheng2, WANG Zi-jian2, XIAO Wen-jing1, WANG Qun1, ZHAO Hong-qun1
摘要: 目的 建立高通量、半自动化细菌全基因组序列测定体系,满足基于基因组序列的细菌性病原体监测的需求。方法 使用自动化液体处理器、可丢弃性机械手枪头、96孔板型核酸提取试剂盒、自动测序文库构建系统以及测序仪,实现细菌基因组序列测定的半自动化。结果 机械手枪头与加样孔底的距离、液体混合速度和每次混匀液体的体积比3个因素与样品之间的交叉污染密切相关,机械手枪头与加样孔底的距离为2 mm、液体混合速度为全速的15%、每次混匀液体的体积比为50%时污染率为0。与手工方法相比,高通量半自动化细菌全基因组序列测定体系的工作效率提高了4倍。结论 建立的高通量、半自动化细菌基因组序列测定体系,能够满足基于基因组序列的细菌性病原体监测的需求。
中图分类号: