两种基因分型方法在河北省鼠疫耶尔森菌基因分型中的应用研究

doi:10.11853/j.issn.1003.8280.2018.06.004

中国媒介生物学及控制杂志 ›› 2018, Vol. 29 ›› Issue (6): 564-566.DOI: 10.11853/j.issn.1003.8280.2018.06.004

两种基因分型方法在河北省鼠疫耶尔森菌基因分型中的应用研究

王海峰, 张懿晖, 杨晓燕, 刘溢洋, 牛艳芬, 刘广

河北省鼠疫防治所检验科, 河北张家口 075000

收稿日期:2018-07-05 出版日期:2018-12-20 发布日期:2018-12-20
作者简介:王海峰,女,副主任技师,主要从事鼠疫检验工作,Email:whf584521@163.com
基金资助:
河北省2017年度医学科学研究重点课题计划（20170466）

Studies on the genotypes of Yersinia pestis in Hebei province by two genotyping methods

WANG Hai-feng, ZHANG Yi-hui, YANG Xiao-yan, LIU Yi-yang, NIU Yan-fen, LIU Guang

Anti-plague Institute of Hebei Province, Zhangjiakou 075000, Hebei Province, China

Received:2018-07-05 Online:2018-12-20 Published:2018-12-20
Supported by:
Supported by the Medical Science Research Project in Hebei Province (No. 20170466)

摘要/Abstract

摘要： 目的分析河北省鼠疫疫源地分离的鼠疫耶尔森菌（鼠疫菌）基因型别和遗传变异特征。方法采取水煮法对康保县1972-2017年分离的鼠疫菌提取DNA，利用已有文献报道的多位点可变数目串联重复序列（MLVA）和差异区段（DFR）两种分型方法，经过PCR扩增，琼脂糖凝胶电泳和序列分析后确定被测菌株的基因型别。结果河北省分离的鼠疫菌MLVA基因分型一致，并确定了串联重复序列位点的重复数目；DFR基因型为G17和G20。G17型主要缺失DFR1、6、7、13、15、16、17、18，G20型主要缺失DFR1、6、7、12、13、15、16、17、18。结论河北省鼠疫疫源地分离的鼠疫菌株遗传特征比较稳定，2017年动物间疫情是邻近地区的疫情蔓延还是当地菌株的遗传变异，需要进一步研究。

关键词: 鼠疫耶尔森菌, 差异区段, 多位点串联重复序列, 基因分型

Abstract: Objective To analyze the genotypes and genetic characteristics of Yersinia pestis isolated from Hebei plague foci. Methods The DNA of Y. pestis collected in Kangbao county from 1972 to 2017 was extracted by boiling method, the multiple locus variable number tandem repeat (MLVA) and the DFR primers according to a publication were synthesized by a biological company, then amplified by polymerase chain reaction, then genotypes were analyzed by agarose gel electrophoresis. Results All of the strains showed one MLVA genotype, and the main genotypes of Y. pestis from Hebei foci were G17 and G20. The absence of DFRs were 1, 6, 7, 13, 15, 16, 17, 18 in G17, the absence of DFRs were 1, 6, 7, 12, 13, 15, 16, 17, 18 in G20. Conclusion The genetic characteristics of enzootic plague in Hebei province remain stable. Further studies are warranted to confirm whether the epidemics among wildlife in 2017 was caused by spread of neighboring foci or by genetic shifting of the pathogen.

Key words: Yersinia pestis, Different regions, Variable number of tandem repeat, Genetic typing

中图分类号:

王海峰, 张懿晖, 杨晓燕, 刘溢洋, 牛艳芬, 刘广. 两种基因分型方法在河北省鼠疫耶尔森菌基因分型中的应用研究[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2018, 29(6): 564-566.

WANG Hai-feng, ZHANG Yi-hui, YANG Xiao-yan, LIU Yi-yang, NIU Yan-fen, LIU Guang. Studies on the genotypes of Yersinia pestis in Hebei province by two genotyping methods[J]. Chines Journal of Vector Biology and Control, 2018, 29(6): 564-566.

[1]	李博, 崔燕, 刘遵季, 古丽阿依·包凯西, 罗勇军, 麦迪娜·肖开提, 王启果, 雒涛. 新疆鼠疫菌株多位点可变数目串联重复序列基因分型研究[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2021, 32(6): 666-671.
[2]	王海峰, 陈永明, 周松, 牛艳芬, 杨晓燕, 张懿晖, 刘广, 杜国义, 刘合智, 史献明. 成簇的规律间隔短回文重复序列技术在鼠疫菌基因分型中的应用[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2021, 32(1): 30-33.
[3]	徐创泽, 朴东日, 姜海, 刘慧兰, 李萌, 田海荣, 焦红岩, 田国忠. 内蒙古阿拉善盟布鲁氏菌病流行特征及病原体分型研究[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2020, 31(6): 648-651.
[4]	李存香, 张青雯, 辛有全, 祁芝珍, 金星, 冯建萍, 李胜, 吴海莲, 赵海红, 代瑞霞. 携带噬菌体的鼠疫耶尔森菌菌落形态研究[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2020, 31(6): 699-701.
[5]	李胜, 何建, 杨晓艳, 辛有全, 靳娟, 张琪, 柏吉祥, 杨汉青, 吴海莲, 代瑞霞. 甘肃省鼠疫耶尔森菌对11种抗菌药物体外抑菌活性研究[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2020, 31(5): 536-539.
[6]	吴海生, 吴海莲, 杨晓艳, 李存香, 熊浩明, 何建, 李翔, 徐小青, 代瑞霞, 张青雯. 青海省海北藏族自治州鼠疫耶尔森菌病原学分析及流行病学意义[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2019, 30(1): 35-39.
[7]	王海峰, 周松, 刘合智, 刘晓伟, 杨顺林, 杜国义, 史献明. 河北省康保县2017年分离的3株鼠疫菌株基因分型及流行病学分析[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2019, 30(1): 40-42.
[8]	高斌, 张涛. 银川市1970-2014年鼠疫自然疫源地调查结果分析[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2018, 29(6): 654-656.
[9]	王海峰, 周松, 李玉贵, 白雪薇, 孙睿, 胡乐乐. 利用差异区段分型方法对沙鼠型鼠疫菌和鼠疫菌EV76疫苗株进行鉴定[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2018, 29(5): 436-438.
[10]	祁腾, 梁莹, 杨军, 罗隆泽, 李帆, 汪立茂, 李伟. 四川省新龙县鼠疫耶尔森菌差异区段分型研究[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2018, 29(5): 442-444.
[11]	冯建萍, 郭文涛, 杨建国, 李存香, 赵海红, 金星, 辛有全, 金丽霞, 熊浩明, 祁芝珍. 5种干粉培养基对鼠疫耶尔森菌生长的影响[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2018, 29(3): 303-304.
[12]	何建, 杨晓艳, 李胜, 靳娟, 张琪, 辛有全, 金泳, 熊浩明, 杨汉青, 魏柏青, 代瑞霞, 祁芝珍. 西藏自治区鼠疫自然疫源地鼠疫耶尔森菌耐药及耐消毒剂基因的研究[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2018, 29(1): 61-63.
[13]	史献明, 杜国义, 王治宇, 杨顺林, 王海峰, 周松, 刘冠纯, 谢树军, 姚剑坤, 崔树学, 杨建明, 张懿晖. 河北省鼠疫自然疫源地鼠疫耶尔森菌变异性研究进展[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2018, 29(1): 100-102.
[14]	高少坤, 杜国义. 动物鼠疫流行静息期与鼠疫质粒变异关系的探讨[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2017, 28(5): 512-514.
[15]	贺金荣, 张渝疆, 王宇萌, 蔡虹, 张志凯, 李伟, 梁莹. 新疆地区58株鼠疫耶尔森菌规律聚集的间隔短回文重复位点多态性分析[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2017, 28(3): 233-237.

两种基因分型方法在河北省鼠疫耶尔森菌基因分型中的应用研究

Studies on the genotypes of Yersinia pestis in Hebei province by two genotyping methods

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