利用差异区段分型方法对沙鼠型鼠疫菌和鼠疫菌EV76疫苗株进行鉴定

doi:10.11853/j.issn.1003.8280.2018.05.003

中国媒介生物学及控制杂志 ›› 2018, Vol. 29 ›› Issue (5): 436-438.DOI: 10.11853/j.issn.1003.8280.2018.05.003

利用差异区段分型方法对沙鼠型鼠疫菌和鼠疫菌EV76疫苗株进行鉴定

王海峰, 周松, 李玉贵, 白雪薇, 孙睿, 胡乐乐

河北省鼠疫防治所检验科, 河北张家口 075000

收稿日期:2018-06-17 出版日期:2018-10-20 发布日期:2018-10-20
作者简介:王海峰,女,副主任技师,从事鼠疫检验工作,Email:whf584521@163.com
基金资助:
河北省2017年度医学科学研究重点课题计划（20170466）

Identification of Yersinia pestis isolates from Mongolian gerbils and the plague vaccine via genotyping of different regions

WANG Hai-feng, ZHOU Song, LI Yu-gui, BAI Xue-wei, SUN Rui, HU Le-le

Anti-plague Institute of Hebei Province, Zhangjiakou 075000, Hebei Province, China

Received:2018-06-17 Online:2018-10-20 Published:2018-10-20
Supported by:
Supported by the Medical Science Research Project in Hebei Province (No. 20170466)

摘要/Abstract

摘要： 目的利用差异区段（DFR）基因分型方法鉴别沙鼠型鼠疫耶尔森菌（鼠疫菌）和鼠疫菌EV76疫苗株。方法采取水煮法对2015年内蒙古自治区杭锦旗、2013年宁夏回族自治区银川市和2003年河北省康保县分离的6株沙鼠型鼠疫菌和鼠疫菌EV76疫苗株提取DNA，引物选用文献报道中的22个差异区段和pMT1，PCR扩增经琼脂糖凝胶电泳后分析其基因型别。结果沙鼠型鼠疫菌DFR基因型分别为G11、G17和G20。G11缺失位点为DFR01、06、07、13、15、16和17，G17缺失位点较G11增加DFR18，G20缺失位点较G17增加DFR12；鼠疫菌EV76疫苗株的缺失位点则为DFR01、02、04和10。结论利用DFR基因分型方法能快速区分沙鼠型鼠疫菌和鼠疫菌EV76疫苗株，可避免工作中因菌苗污染而造成分离到鼠疫菌的假象，鼠疫菌株基因型别的鉴定可以快速追溯疫情来源。

关键词: 鼠疫耶尔森菌, 鼠疫菌EV76疫苗株, 差异区段, 基因分型

Abstract: Objective To identify Yersinia pestis from the Mongolian gerbils and EV76 bacteria of plague by different region (DFR) fragment genotyping. Methods The DNA of 6 strains of Y. pestis and EV76 isolates was extracted by boiling method from Hangjinqi of Inner Mongolia in 2015, Yinchuan city of Ningxia Hui Autonomous Region in 2013, and Kangbao county of Hebei province in 2003. The DFR primers according to a report were synthesized by biological company, then amplified by PCR, analyzed genotype through agarose gel electrophoresis. Results The DFR genotypes of Y. pestis from Mongolian gerbils were G11, G17, and G20. The absent points of G11 were DFR01, 06, 07, 13, 15, 16, and 17; DFR18 was also absent for G17 in addition to the above; The absent point of G20 also included DFR12 in addition to G17. The absence DFRs of EV76 were 01, 02, 04, and 10. Conclusion Using the differential fragment genotyping method can quickly distinguish Y. pestis isolates from Mongolian gerbils and EV76. At the same time, it is possible to trace the source of the epidemic rapidly by identifying the genotype of wild strains.

Key words: Yersinia pestis, EV76, Different region, Genetic typing

中图分类号:

王海峰, 周松, 李玉贵, 白雪薇, 孙睿, 胡乐乐. 利用差异区段分型方法对沙鼠型鼠疫菌和鼠疫菌EV76疫苗株进行鉴定[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2018, 29(5): 436-438.

WANG Hai-feng, ZHOU Song, LI Yu-gui, BAI Xue-wei, SUN Rui, HU Le-le. Identification of Yersinia pestis isolates from Mongolian gerbils and the plague vaccine via genotyping of different regions[J]. Chines Journal of Vector Biology and Control, 2018, 29(5): 436-438.

[1]	李博, 崔燕, 刘遵季, 古丽阿依·包凯西, 罗勇军, 麦迪娜·肖开提, 王启果, 雒涛. 新疆鼠疫菌株多位点可变数目串联重复序列基因分型研究[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2021, 32(6): 666-671.
[2]	王海峰, 陈永明, 周松, 牛艳芬, 杨晓燕, 张懿晖, 刘广, 杜国义, 刘合智, 史献明. 成簇的规律间隔短回文重复序列技术在鼠疫菌基因分型中的应用[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2021, 32(1): 30-33.
[3]	徐创泽, 朴东日, 姜海, 刘慧兰, 李萌, 田海荣, 焦红岩, 田国忠. 内蒙古阿拉善盟布鲁氏菌病流行特征及病原体分型研究[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2020, 31(6): 648-651.
[4]	李存香, 张青雯, 辛有全, 祁芝珍, 金星, 冯建萍, 李胜, 吴海莲, 赵海红, 代瑞霞. 携带噬菌体的鼠疫耶尔森菌菌落形态研究[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2020, 31(6): 699-701.
[5]	李胜, 何建, 杨晓艳, 辛有全, 靳娟, 张琪, 柏吉祥, 杨汉青, 吴海莲, 代瑞霞. 甘肃省鼠疫耶尔森菌对11种抗菌药物体外抑菌活性研究[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2020, 31(5): 536-539.
[6]	吴海生, 吴海莲, 杨晓艳, 李存香, 熊浩明, 何建, 李翔, 徐小青, 代瑞霞, 张青雯. 青海省海北藏族自治州鼠疫耶尔森菌病原学分析及流行病学意义[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2019, 30(1): 35-39.
[7]	王海峰, 周松, 刘合智, 刘晓伟, 杨顺林, 杜国义, 史献明. 河北省康保县2017年分离的3株鼠疫菌株基因分型及流行病学分析[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2019, 30(1): 40-42.
[8]	王海峰, 张懿晖, 杨晓燕, 刘溢洋, 牛艳芬, 刘广. 两种基因分型方法在河北省鼠疫耶尔森菌基因分型中的应用研究[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2018, 29(6): 564-566.
[9]	高斌, 张涛. 银川市1970-2014年鼠疫自然疫源地调查结果分析[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2018, 29(6): 654-656.
[10]	祁腾, 梁莹, 杨军, 罗隆泽, 李帆, 汪立茂, 李伟. 四川省新龙县鼠疫耶尔森菌差异区段分型研究[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2018, 29(5): 442-444.
[11]	冯建萍, 郭文涛, 杨建国, 李存香, 赵海红, 金星, 辛有全, 金丽霞, 熊浩明, 祁芝珍. 5种干粉培养基对鼠疫耶尔森菌生长的影响[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2018, 29(3): 303-304.
[12]	何建, 杨晓艳, 李胜, 靳娟, 张琪, 辛有全, 金泳, 熊浩明, 杨汉青, 魏柏青, 代瑞霞, 祁芝珍. 西藏自治区鼠疫自然疫源地鼠疫耶尔森菌耐药及耐消毒剂基因的研究[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2018, 29(1): 61-63.
[13]	史献明, 杜国义, 王治宇, 杨顺林, 王海峰, 周松, 刘冠纯, 谢树军, 姚剑坤, 崔树学, 杨建明, 张懿晖. 河北省鼠疫自然疫源地鼠疫耶尔森菌变异性研究进展[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2018, 29(1): 100-102.
[14]	高少坤, 杜国义. 动物鼠疫流行静息期与鼠疫质粒变异关系的探讨[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2017, 28(5): 512-514.
[15]	贺金荣, 张渝疆, 王宇萌, 蔡虹, 张志凯, 李伟, 梁莹. 新疆地区58株鼠疫耶尔森菌规律聚集的间隔短回文重复位点多态性分析[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2017, 28(3): 233-237.

利用差异区段分型方法对沙鼠型鼠疫菌和鼠疫菌EV76疫苗株进行鉴定

Identification of Yersinia pestis isolates from Mongolian gerbils and the plague vaccine via genotyping of different regions

PDF

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价