江苏口岸褐家鼠线粒体DNA细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因的遗传多态性研究

doi:10.11853/j.issn.1003.8280.2017.01.009

中国媒介生物学及控制杂志 ›› 2017, Vol. 28 ›› Issue (1): 31-34.DOI: 10.11853/j.issn.1003.8280.2017.01.009

江苏口岸褐家鼠线粒体DNA细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因的遗传多态性研究

胡双双¹, 吴炳耀², 何江², 陆永昌³, 杨庆贵², 陈峰⁴, 孙立新²

1 安徽理工大学医学院, 安徽淮南 232001;
2 江苏国际旅行卫生保健中心, 南京 210019;
3 江苏出入境检验检疫局, 南京 210001;
4 南通出入境检验检疫局, 江苏南通 226000

收稿日期:2016-09-27 出版日期:2017-02-20 发布日期:2017-02-20
通讯作者: 孙立新,Email:slxdt63@163.com
作者简介:胡双双,女,在读硕士,主要从事生物医学工程专业及分子生物学研究,Email:gnauhshu@163.com
基金资助:
国家质检总局科研基金项目（2006IK130）

Research of the cytochrome C oxidase subunitⅠ gene polymorphisms for Rattus norvegicus in Jiangsu port

HU Shuang-shuang¹, WU Bing-yao², HE Jiang², LU Yong-chang³, YANG Qing-gui², CHEN Feng⁴, SUN Li-xin²

1 School of Medicine, Anhui University of Science and Technology, Huainan 232001, Anhui Province, China;
2 Jiangsu International Travel Healthcare Center;
3 Jiangsu Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau;
4 Nantong Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau

Received:2016-09-27 Online:2017-02-20 Published:2017-02-20
Supported by:
Supported by the Science and Technology Project of General Administration of Quality Supervision, Inspection and Quarantine of the People's Republic of China（No. 2006IK130）

摘要/Abstract

摘要：

目的研究褐家鼠线粒体DNA细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ（COⅠ）基因的遗传多态性特征，为国境口岸鼠形动物的鉴定和溯源提供技术支持。方法通过对江苏口岸本底及输入性褐家鼠COⅠ基因的扩增、测序和比对，结合GenBank的褐家鼠信息，对褐家鼠进行遗传多态性分析和系统发育树研究。结果获得48个国内外褐家鼠COⅠ基因序列，测出的605个序列位点中保守位点587个，可变异位点18个，核苷酸平均差异数为（2.510 000±0.000 640）；江苏口岸本底褐家鼠仅为1个单倍型，非江苏口岸褐家鼠多态性丰富。结论不同地区的褐家鼠具有一定的种内差异，该差异与地理位置分布有一定的关系。

关键词: 褐家鼠, 细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因, 基因多样性, 地理分布

Abstract:

Objective The cytochrome C oxidase subunitⅠ(COⅠ) gene polymorphisms for Rattus norvegicus, was studied to provide support for the species identification of rodents from frontier port. Methods The COⅠ gene of R. norvegicus was amplified, sequenced, aligned and compared with the information on GenBank to analyze genetic polymorphism and create phylogenetic tree for R. norvegicus. Results Forty-eight COⅠ gene sequences were obtained from R. norvegicus. In this research, 605 loci were measured in each sequence, there were 587 conservative loci and 18 mutation loci, the nucleotide differences number was (2.510 000±0.000 640) on average. All of R. norvegicus in Jiangsu port background only shared one haploid type, other R. norvegicus' nucleotide polymorphism was rich. Conclusion There are species differences of the R. norvegicus in different areas, this kind of difference is related to the geographical origin.

Key words: Rattus norvegicus, Cytochrome C oxidase subunitⅠgene, Genetic diversity, Geographical distribution

中图分类号:

S443

胡双双, 吴炳耀, 何江, 陆永昌, 杨庆贵, 陈峰, 孙立新. 江苏口岸褐家鼠线粒体DNA细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因的遗传多态性研究[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2017, 28(1): 31-34.

HU Shuang-shuang, WU Bing-yao, HE Jiang, LU Yong-chang, YANG Qing-gui, CHEN Feng, SUN Li-xin. Research of the cytochrome C oxidase subunitⅠ gene polymorphisms for Rattus norvegicus in Jiangsu port[J]. Chines Journal of Vector Biology and Control, 2017, 28(1): 31-34.

[1]	刘国平, 梁国栋. 中国8省（自治区）31县（旗、市）吸血蠓地理分布调查（双翅目：蠓科）[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2021, 32(4): 487-493.
[2]	曾旭灿, 许翔, 杨锐, 魏春, 吴林波, 罗春海, 孙晓东. 云南省中华按蚊种群mtDNA-COⅠ基因序列的遗传结构分析[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2021, 32(3): 265-270.
[3]	师佳佳, 吕明洁, 袁中良. 郑州市蜱类地理分布、寄生宿主及季节消长调查[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2021, 32(3): 361-364.
[4]	李心玫, 孙梦涛, 詹雨娟, 张兰香, 李梦珠, 陶东东, 孙恩涛. 马六甲肉食螨与转开肉食螨的形态及分子鉴定[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2021, 32(2): 230-234.
[5]	兰晓宇, 鲁亮, 候芝林, 杜国义, 史献明, 崔耀仁, 刘冠纯, 陈永明, 康东梅, 郑楠, 任兴宇, 闫东. DNA条形码技术在河北省鼠疫疫源地常见蚤种鉴定中的应用[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2020, 31(6): 662-666.
[6]	刘天, 夏世国, 梅芳盛, 郝海波, 聂晓培, 黄继贵, 姚梦雷, 刘力, 杨瑞, 胡兵, 吴杨, 童叶青, 陈琦. 湖北省荆州市2017－2018年肾综合征出血热宿主动物监测结果分析[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2020, 31(4): 469-473.
[7]	姚丹丹, 姜洪雪, 隋晶晶, 冯志勇. 广东省江门市捕获鼠类的DNA条形码分析[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2020, 31(3): 305-309.
[8]	刘维俊, 徐国英, 肖方震, 林代华, 刘菁, 韩腾伟. DNA条形码技术在福建省鼠种鉴定中的应用[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2020, 31(2): 175-179.
[9]	吕艳, 张莉, 李海龙. 我国肝毛细线虫感染研究现状[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2020, 31(2): 239-246.
[10]	尹小平, 刘戈, 王安东, 颜彬, 白岑, 田延河, 张兆冠, 赵姗姗, 王远志. DNA条形码技术在蚤类鉴定中的应用[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2019, 30(5): 561-563.
[11]	郭丽民, 席进孝, 盖永志, 吴斌, 王世明, 苗克军, 穆洮霞, 徐大琴. 甘肃省鼠疫疫源地啮齿动物DNA条形码分析[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2019, 30(2): 176-179.
[12]	刘阳, 张韶华, 梁焯南, 朱毅朝, 梁桂. 广东省深圳市2017年褐家鼠对抗凝血杀鼠剂抗药性研究[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2018, 29(6): 617-620.
[13]	张瑞玲, 黄振东, 刘同凯, 赵爱华, 张忠. DNA条形码技术在臭虫物种鉴定中的应用[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2018, 29(5): 458-461.
[14]	李春敏, 董学书, 杨明东. 云南省埃及伊蚊地理分布与季节消长[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2018, 29(4): 394-396.
[15]	杨中华, 周红宁. 云南省三带喙库蚊生物学习性研究进展[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2018, 29(4): 403-406.

江苏口岸褐家鼠线粒体DNA细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因的遗传多态性研究

Research of the cytochrome C oxidase subunitⅠ gene polymorphisms for Rattus norvegicus in Jiangsu port

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